Unity4.6で開発中のプロジェクトをUnity5にコンバートした後、Web Playerで影が出なくなったので、Quality設定を確認。(辿りつくまで数時間悩んだ)
quality
※[Edit]=>[Project Settings]=>[Quality]

各プラットフォームのデフォルト値が全部Fastestになってました。Web Player(一番左)は確か以前はSimpleだったよな、と思い出してデフォルト値をSimpleに再設定。
結果、影が出るようになりました。